1. ストリップゲルをMilli-Q水で軽くすすいでオイルを除いた後、下記のSDS処理液中で30分間軽く揺する。（次のアルキル化処理を行なわない場合、 このインキュベーション時間を50分に延ばす）

SDS処理液：
urea　14.5 g
dithiothreitol　0.2 g
0.5 M Tris-HCl, pH 6.8　2.0 ml
10%(w/v) SDS stock　8.0 ml
0.1%(w/v) BPB　　.0 ml
60%(v/v) glycerol　20.0 ml

2. ストリップゲルを下記のアルキル化処理液中で20分間軽く揺する。（質量分析を行なわない場合にはこの処理は不必要）

アルキル化処理液：
0.5 M Tris-HCl, pH 6.8　2.0 ml
10%(w/v) SDS stock　8.0 ml
0.1%(w/v) BPB　1.0 ml
60%(v/v) glycerol　20.0 ml
Milli-Q water　9.0 ml
iodoacetamide　1.8 g

3. （直ちに２次元目のSDS電気泳動を行うことができない時には、乾燥しないようにサランラップで包み -80℃で凍結保存する）